Fontignano è un piccolo borgo nei pressi del Lago Trasimeno, a metà strada tra Perugia e Città della Pieve. I primi documenti storici su Fontignano risalgono al XII secolo; nel 1158 passa sotto la giurisdizione di Perugia e assume la denominazione di castrum solo nel 1380. Nel 1400 è la sede delle truppe di Braccio Fortebraccio e nel 1500, di quelle di Cesare Borgia.

Per trascorrere in tranquillità gli ultimi anni della sua vita, Pietro Vannucci si trasferisce proprio a Fontignano nel 1511, dove insedia la sua bottega e la usa come punto di riferimento per poi spostarsi nel territorio circostante per realizzare le opere commissionate. Probabilmente, il Perugino si trasferisce in questo luogo isolato sulle colline per sfuggire alle condizioni igieniche precarie di Perugia e della maggior parte dei grandi centri abitati dell’epoca. È il periodo della peste, ed è proprio questa malattia a colpire il divin pittore nel 1523, mentre stava affrescando la Chiesa dell’Annunziata, e a causarne la morte lo stesso anno. Inizialmente, per paura del contagio, il corpo del Perugino viene seppellito fuori dal borgo, sotto una grande quercia e solo cinquant’anni dopo, i resti del suo corpo vengono riesumati e trasferiti all’interno della Chiesa dell’Annunziata, dove ancora oggi le sue spoglie sono conservate all’interno di un’urna.